Tomaž Vrtovec je leta 2002 diplomiral iz elektrotehnike na Univerzi v Ljubljani, leta 2007 doktoriral iz elektrotehniških znanosti na Univerzi v Ljubljani in leta 2011 doktoriral iz medicinskih znanosti na Univerzi v Utrechtu na Nizozemskem. Med študijem je bil gostujoči raziskovalec na inštitutu CSIRO v Avstraliji ter na Univerzitetnem kliničnem centru Utrecht na Nizozemskem. Od leta 2019 je redni profesor na Univerzi v Ljubljani, Fakulteti za elektrotehniko, kjer je od leta 2023 tudi predstojnik Katedre za biomedicinsko tehniko. Njegovo raziskovalno delo v okviru Laboratorija za slikovne tehnologije obsega analizo medicinskih slik, biomedicinsko tehniko ter razvoj aplikacij, predvsem na področju hrbtenične kirurgije in načrtovanja radioterapije. V preteklosti je bil član programskega odbora konference MICCAI 2016, član organizacijskega odbora delavnic MICCAI CSI 2015 & 2016 in MICCAI MSKI 2017 & 2018 ter predsednik komisije za nagrado za najboljši študentski članek na konferenci IEEE ISBI 2016. Trenutno opravlja funkcijo člana programskega odbora za konferenco SPIE Medical Imaging: Image Processing, ter funkcijo pridruženega urednika za znanstvene revije Journal of Medical Imaging, Image Analysis & Stereology ter Zdravniški vestnik.

Doktorat iz medicinskih znanosti (Univerza v Utrechtu, Fakulteta za medicino, Nizozemska)

Doktorat iz elektrotehniških znanosti (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Diploma iz elektrotehnike (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Redni profesor (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Izredni profesor (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Docent (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Učitelj (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Gostujoči raziskovalec na Image Sciences Institute (Univerzitetni klinični center Utrecht, Nizozemska)

Asistent (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Gostujoči raziskovalec v BioMedIA Lab (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation - CSIRO, Sydney, Avstralija)

Mladi raziskovalec v Laboratoriju za slikovne tehnologije (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Raziskovalec v Laboratoriju za slikovne tehnologije (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Priznanje za odličen končni uspeh na študiju elektrotehnike (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Priznanje za študijske dosežke (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Član organizacijskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications in Musculoskeletal Imaging, MSKI 2017 in MSKI 2018 (delavnica v povezavi z 20th / 21th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2017 / MICCAI 2018)

Predsednik odbora za nagrado za najboljši študentski članek - IEEE ISBI 2016 (13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging)

Član programskega odbora - MICCAI 2016 (19th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention)

Član organizacijskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications for Spine Imaging, CSI 2015 in CSI 2016 (delavnica v povezavi z 18th / 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2015 / MICCAI 2016)

Član programskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications for Spine Imaging, CSI 2013 in CSI 2014 (delavnica v povezavi z 16th / 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2013 / MICCAI 2014)

Recenzent prispevkov za mednarodne revije (npr. IEEE TMI, IEEE TBME, MedIA, IJCARS, CMPB, PMB, MedPhys, Spine, itn.), recenzent prispevkov za mednarodne konference (npr. MICCAI, IPMI, ICPR, ISBI, MIAR, itn.), recenzent prijav za mednarodne projekte (npr. FHB Hong Kong, CRC Kanada, NWO Nizozemska, itn.)

Skupna raziskava za segmentacijo kritičnih organov pri načrtovanju radioterapije (ULFE-UCPH-2023)

Razvoj programske opreme na podlagi algoritmov aktivnih modelov oblike in globokega učenja za uporabo v analizi medicinskih slik hrbtenice (Raylytic GmbH)

Sepideh Amiri, Reza Karimzadeh, Tomaž Vrtovec, Erik Gudmann Steuble Brandt, Henrik S. Thomsen, Michael Brun Andersen, Christoph Felix Müller, Anders Bertil Rodell, Bulat Ibragimov: Centerline-guided reinforcement learning model for pancreatic duct identifications. Journal of Medical Imaging, 11(6):064002, 2024 [doi:10.1117/1.JMI.11.6.064002 ] [COBISS-ID: ]

Gašper Podobnik, Bulat Ibragimov, Elias Tappeiner, Chanwoong Lee, Jin Sung Kim, Zacharia Mesbah, Romain Modzelweski, Yihao Ma, Fan Yang, Mikołaj Rudecki, Marek Wodziński, Primož Peterlin, Primož Strojan, Tomaž Vrtovec: HaN-Seg: The head and neck organ-at-risk CT and MR segmentation challenge. Radiotherapy and Oncology, 198:110410, 2024 [doi:10.1016/j.radonc.2024.110410 ] [COBISS-ID:202738179 ]

Sepideh Amiri, Tomaž Vrtovec, Tamerlan Mustafaev, Christopher L. Deufel, Henrik S. Thomsen, Martin Hylleholt Sillesen, Erik Gudmann Steuble Brandt, Michael Brun Andersen, Christoph Felix Müller, Bulat Ibragimov: Reinforcement learning-based anatomical maps for pancreas sub-region and duct segmentation. Medical Physics, 51(10):7378-7392, 2024 [doi:10.1002/mp.17300 ] [COBISS-ID:202626819 ]

Gašper Podobnik, Bulat Ibragimov, Primož Peterlin, Primož Strojan, Tomaž Vrtovec: vOARiability: interobserver and intermodality variability analysis in OAR contouring from head and neck CT and MR images. Medical Physics, 51(3):2175-2186, 2024 [doi:10.1002/mp.16924 ] [COBISS-ID:181670147 ]

Gašper Podobnik, Primož Strojan, Primož Peterlin, Bulat Ibragimov, Tomaž Vrtovec: HaN-Seg: The head and neck organ-at-risk CT & MR segmentation dataset. Medical Physics, 50(3):1917-1927, 2023 [doi:10.1002/mp.16197 ] [COBISS-ID:136767491 ]