Tomaž Vrtovec

prof.
dr. Tomaž Vrtovec

Redni profesor

Kratek življenjepis

Tomaž Vrtovec je leta 2002 diplomiral iz elektrotehnike na Univerzi v Ljubljani, leta 2007 doktoriral iz elektrotehniških znanosti na Univerzi v Ljubljani in leta 2011 doktoriral iz medicinskih znanosti na Univerzi v Utrechtu na Nizozemskem. Med študijem je bil gostujoči raziskovalec na inštitutu CSIRO v Avstraliji ter na Univerzitetnem kliničnem centru Utrecht na Nizozemskem. Od leta 2019 je redni profesor na Univerzi v Ljubljani, Fakulteti za elektrotehniko. Njegovo raziskovalno delo v Laboratoriju za slikovne tehnologije obsega analizo medicinskih slik, biomedicinsko tehniko ter razvoj aplikacij, predvsem na področju hrbtenične kirurgije in načrtovanja radioterapije. V preteklosti je bil član programskega odbora konference MICCAI 2016, član organizacijskega odbora delavnic MICCAI CSI 2015 & 2016 in MSKI 2017 & 2018 MICCAI ter predsednik komisije za nagrado za najboljši študentski članek na konferenci IEEE ISBI 2016. Trenutno opravlja funkcijo člana programskega odbora za konferenco SPIE Medical Imaging: Image Processing, ter funkcijo pridruženega urednika za znanstveni reviji Image Analysis & Stereology in Journal of Medical Imaging.

Izobrazba

2011
Doktorat iz medicinskih znanosti (Univerza v Utrechtu, Fakulteta za medicino, Nizozemska)
2007
Doktorat iz elektrotehniških znanosti (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2002
Diploma iz elektrotehnike (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Habilitacije

2019
Redni profesor (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2014
Izredni profesor (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2009
Docent (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Zaposlitve

2017 -- danes
Učitelj (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2010
Gostujoči raziskovalec na Image Sciences Institute (Univerzitetni klinični center Utrecht, Nizozemska)
2007 -- 2017
Asistent (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2005 -- 2006
Gostujoči raziskovalec v BioMedIA Lab (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation - CSIRO, Sydney, Avstralija)
2003 -- 2007
Mladi raziskovalec v Laboratoriju za slikovne tehnologije (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)
2002
Raziskovalec v Laboratoriju za slikovne tehnologije (Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko)

Aktivnosti

2017 -- 2018
Član organizacijskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications in Musculoskeletal Imaging, MSKI 2017 in MSKI 2018 (delavnica v povezavi z 20th / 21th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2017 / MICCAI 2018)
2016
Predsednik odbora za nagrado za najboljši študentski članek - IEEE ISBI 2016 (13th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging)
2016
Član programskega odbora - MICCAI 2016 (19th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention)
2015 -- 2016
Član organizacijskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications for Spine Imaging, CSI 2015 in CSI 2016 (delavnica v povezavi z 18th / 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2015 / MICCAI 2016)
2013 -- 2014
Član programskega odbora - Computational Methods and Clinical Applications for Spine Imaging, CSI 2013 in CSI 2014 (delavnica v povezavi z 16th / 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2013 / MICCAI 2014)
2011 -- danes
Recenzent prispevkov za mednarodne revije (npr. IEEE TMI, IEEE TBME, MedIA, IJCARS, CMPB, PMB, MedPhys, Spine, itn.), recenzent prispevkov za mednarodne konference (npr. MICCAI, IPMI, ICPR, ISBI, MIAR, itn.), recenzent prijav za mednarodne projekte (npr. FHB Hong Kong, CRC Kanada, NWO Nizozemska, itn.)

Projekti

2023 -- 2023
Skupna raziskava za segmentacijo kritičnih organov pri načrtovanju radioterapije (ULFE-UCPH-2023)
2017 -- 2018
Razvoj programske opreme na podlagi algoritmov aktivnih modelov oblike in globokega učenja za uporabo v analizi medicinskih slik hrbtenice (Raylytic GmbH)

Zadnje objave

2023
Gašper Podobnik, Primož Strojan, Primož Peterlin, Bulat Ibragimov, Tomaž Vrtovec: HaN-Seg: The head and neck organ-at-risk CT & MR segmentation dataset. Medical Physics, 50(3):1917-1927, 2023 [doi:10.1002/mp.16197 ]
2022
Danis Alukaev, Semen Kiselev, Tamerlan Mustafaev, Ahatov Ainur, Bulat Ibragimov, Tomaž Vrtovec: A deep learning framework for vertebral morphometry and Cobb angle measurement with external validation. European Spine Journal, 31(8):2115-2124, 2022 [doi:10.1007/s00586-022-07245-4 ]
2022
Ivana Išgum, Bennett A. Landman, Tomaž Vrtovec: Advances in High-Dimensional Medical Image Processing. Journal of Medical Imaging, 9(5):052401, 2022 [doi:10.1117/1.JMI.9.5.052401 ]
2022
Imad Eddine Ibrahim Bekkouch, Bulat Maksudov, Semen Kiselev, Tamerlan Mustafaev, Tomaž Vrtovec, Bulat Ibragimov: Multi-landmark environment analysis with reinforcement learning for pelvic abnormality detection and quantification. Medical Image Analysis, 78:102417, 2022 [doi:10.1016/j.media.2022.102417 ]
2022
Tomaž Vrtovec, Bulat Ibragimov: Spinopelvic measurements of sagittal balance with deep learning: systematic review and critical evaluation. European Spine Journal, 31(8):2031-2045, 2022 [doi:10.1007/s00586-022-07155-5 ]